Apache - (104)Connection reset by peer: mod fcgid: error reading data from FastCGI server

В логах веб-сервера для сайта ошибка вида:

[Tue Apr 18 20:11:44 2017] [warn] [client xxx] (104)Connection reset by peer: mod_fcgid: error reading data from FastCGI server
[Tue Apr 18 20:11:44 2017] [error] [client xxx] Premature end of script headers: index.php

Одна из возможных причин - не добавлены обработчики в конфиге Apache для корневой папки (пример для ISPManager 4):

<Directory /var/www/user11/data/www/site.com>
       Options +ExecCGI +Includes
       FCGIWrapper /var/www/php-bin/user11/php .php
       FCGIWrapper /var/www/php-bin/user11/php .php3
       FCGIWrapper /var/www/php-bin/user11/php .php4
       FCGIWrapper /var/www/php-bin/user11/php .php5
       FCGIWrapper /var/www/php-bin/user11/php .phtml
</Directory>

Другая причина - скрипт требует версию PHP выше чем сейчас.