Proftpd - ftpasswd - утилита для создания и обновления файлов AuthUserFile, AuthGroupFile, UserPassword

для CentOS 6/7 можно установить командой:

# yum install proftpd-utils

Пример - обновляем файл /etc/proftpd.passwd для пользователя user1

# ftpasswd --file /etc/proftpd.passwd --passwd --name=user1 --home=/var/www/user1/data/ --shell=/bin/false --uid=200 --gid=200

вводим пароль и проверяем авторизацию через FTP.

Links: